Produksjonskostnadene for produksjonslinjer for fiskefôrpellets er høye.

Mange bekymrer seg for at investeringskostnadene til fiskefôrpelletsmaskiner er for høye og ikke lønner seg. Faktisk er avkastningen på investeringen for fiskefôrpelletsmaskiner relativt betydelig. Selv om startinvesteringen kan være stor, kan hjemmelaget fôr i det lange løp redusere fôrkostnadene betydelig, spesielt når markedsprisene svinger mye, hvor fordelene med hjemmelaget fôr blir enda tydeligere. Hjemmelaget fôr kan formuleres i henhold til behovene til akvakultur, noe som forbedrer oppdrettseffektiviteten ytterligere.